image Trang chủ image
english vietnam
Dữ liệu của 3,000 genome cây lúa đã được công bố và được khai thác miễn phí trên AWS Cloud
Theo: - Cập nhật lúc: 08:18:31 - 04/12/2015

Dự án 3000 genome cây lúa là một dự án quốc tế với sự tham gia của nhiều đối tác trên khắp thế giới. Dự án đã giải trình tự của khoảng 3024 giống lúa có nguồn gốc từ 89 quốc gia trên thế giới. Nguồn dữ liệu khổng lồ này làn guồn tài nguyên vô cùng giá trị cho khai thác các biến dị di truyền tự nhiên của cây lúa cũng như khám phá các gen mới liên quan đến các đặc tính nông học và hiệu quả kinh tế. Dự án này cũng sẽ giúp tăng tốc độ cải tiến các giống lúa trên toàn cầu nhằm hướng đến mục tiêu an ninh lương thực cho một dân số đang tăng trưởng nhanh chóng và sẽ đạt ngưỡng hơn 9.6 tỉ người vào năm 2050 mà trong đó, hơn phân nữa dân số thế giới phụ thuộc vào nguồn lương thực là lúa gạo. 

Ngân hàng gen lúa quốc tế tại IRRI (Philippines) hiện lưu trữ hơn 127.000 giống lúa từ khắp nơi trên thế giới. Những giống lúa này mang nguồn gen/tính trạng quý chưa được khai thác để tạo ra các giống lúa canh tác theo hướng bền vững trong một môi trường ngày càng bất lợi do các thay đổi khí hậu toàn cầu. Các tính trạng được tập trung khai thác cho việc cải tiến giống bao gồm chọn giống lúa giàu dinh dưỡng, chống chịu sâu bệnh hại và môi trường bất lợi như lũ lụt, khô hạn, giảm phát thải khí nhà kính.

Ba viện nghiên cứu gồm viện hàn lâm khoa học nông nghiệp Trung Quốc (CAAS), viện gen Bắc Kinh (BGI) và viện lúa quốc tế IRRI đã hợp tác với nhau để giải trình tự genome của 3024 giống và dòng lúa được lưu trữ tại các ngân hàng gen của IRRI (82%) và tại CAAS (18%). Việc giải trình tự và phân tích dữ liệu được tài trợ bơi quỹ Bill & Melinda Gates kết hợp nguồn tài trợ từ bộ KH&CN Trung Quốc. Cơ sở dữ liệu này chứa hàng triệu trình tự gen từ các giống lúa khác nhau. Khi kết hợp dữ liệu về trình tự gen với các đo đạc về kiểu hình, sự biểu hiện gen và các thông tin khác sẽ cung cấp nền tảng quan trọng để thiết lập các liên kết giữa gen-tính trạng nhằm xây dựng các mô hình dự đoán và ứng dụng các mô hình này cho các chương trình chọn giống trong tương lai.

Thông qua sự tài trợ của chương trình “đối tác khoa học về lúa gạo trên toàn cầu”, 3024 bộ gen của cây lúa đã được lặp lại quá trình giải mã và so sánh đối chiếu với năm giống lúa phổ biến (năm giống này đại diện cho các nhóm phụ đã được trồng phổ biến bao gồm lúa indica, japonica và aus). Dự án 3K RGP đã thu được nguồn dữ liệu khổng lồ lên đến 120 tetrabytes và hiện vượt quá khả năng tính toán của hầu hết các viện nghiên cứu. Tuy vậy, các dữ liệu mới này giờ đây đã được cung cấp miễn phí trên nguồn internet như một nguồn dữ liệu công cộng (Amazon Web Services = AWS). Việc tiếp cận nguồn dữ liệu là hoàn toàn miễn phí và quá trình sử dụng nguồn dữ liệu được kiểm soát bởi các chuyên gia phân tích dữ liệu và người dùng tuân thủ theo tuyên bố Toronto (Toronto Statement). Thông tin chi tiết tại: http://irri.org/news/media-releases/big-data-on-3-000-rice-genomes-available-on-the-aws-cloud

bình luận 0 Lượt xem 5060
Tin mới hơn
Tin cũ hơn
TIN TỨC NỔI BẬT
Xem tất cảicon
Thông báo Tuyển sinh đào tạo trình độ tiến sĩ năm 2024 đợt I - 15/03/2024
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 31/8/2023 đến ngày 10/9/2023 - 20/09/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 13/8/2023 đến ngày 30/8/2023 - 19/09/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 2/8/2023 đến ngày 12/8/2023 - 14/08/2023
HỘI THẢO KHOA HỌC BÁO CÁO KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM VỤ HÈ THU 2022 VÀ VỤ ĐÔNG XUÂN 2022-2023 - 14/08/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 11/7/2023 đến ngày 1/8/2023 - 03/08/2023
THÔNG BÁO CÔNG NHẬN KẾT QUẢ THI TUYỂN VIÊN CHỨC NĂM 2023 CỦA VIỆN LÚA ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG - 26/07/2023
KẾT QUẢ THI PHỎNG VẤN VÒNG 2 KỲ THI TUYỂN VIÊN CHỨC NĂM 2023 CỦA VIỆN LÚA ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG - 19/07/2023
BÁO CÁO KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM VỤ HÈ THU 2022 VÀ ĐÔNG XUÂN 2022-2023 - 14/07/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 1/7/2023 đến ngày 10/7/2023 - 12/07/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 22/6/2023 đến ngày 30/6/2023 - 12/07/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 1/6/2023 đến ngày 21/6/2023 - 29/06/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 15/5/2023 đến ngày 31/5/2023 - 29/06/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 18/1/2023 đến ngày 14/5/2023 - 01/06/2023
KẾT QUẢ THI VÒNG 1 KỲ THI TUYỂN VIÊN CHỨC NĂM 2023 CỦA VIỆN LÚA ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG - 24/05/2023
Polysaccharide monooxygenases (MoPMO9A)-Mục tiêu mới cho thuốc trừ đạo ôn ở lúa - 15/05/2023
CYCLOARTENYL FERULATE (CAF)-HOẠT CHẤT QUI ĐỊNH LỢI ÍCH SỨC KHỎE CỦA GẠO LỨT - 11/05/2023
VIỆN LÚA ĐBSCL THÔNG BÁO VỀ VIỆC THI TUYỂN DỤNG VIÊN CHỨC NĂM 2023 - 04/05/2023
MỜI THAM DỰ SINH HOẠT HỌC THUẬT TẠI VIỆN 20/4/2023 - 19/04/2023
VIỆN LÚA ĐBSCL CÙNG SYNGENTA VIỆT NAM KÝ KẾT HỢP TÁC TĂNG CƯỜNG NGHIÊN CỨU VÀ PHÁT TRIỂN GIỐNG CÂY TRỒNG - 19/04/2023
Video

 

 

 

Thành tích của viện
 Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới năm 2000
 Huân chương độc lập
        - Hạng I năm 2014
       -  Hạng II năm 2007
        - Hạng III năm 2002
 Huân chương lao động
        - Hạng I năm 1996
        - Hạng II năm 1990
        - Hạng III năm 1986
Giải thưởng Hồ Chí Minh về khoa học công nghệ
        - 10 nhà khoa học được nhận năm 2000
Giải thưởng  Kovalepskaia
        - Tập thể các nhà khoa học nữ thuộc Phòng Di truyền giống (năm 1995)
        - Cá nhận TS. Nguyễn Thị Lộc (năm 2011)
Giải Thưởng Bông Lúa Vàng Viết nam lần thứ nhất năm 2012
        - Giống lúa OM 6976 tác giả Trần Thị Cúc Hòa, Phạm Trung Nghĩa và CTV
        - Giống lúa OM 4900 tác giả Nguyễn Thị Lang,  Bùi Chí Bửu và CTV
- Giải thưởng phụ nữ Việt Nam 2013 cho tập thể nữ CBCNVLĐ - Viện lúa ĐBSCL

Liên kết website
Trang chủ | Giới thiêu Viện Lúa ĐBSCL | Sơ đồ site

Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long
Head Office: Tan Thanh Commune, Thoi Lai District, CanTho City
Tel: (+84) 292 3861954; Fax: (+84) 292 3861457
Copyright © 2011 Cuu Long Delta Rice Research Institute

Tổng lượt truy cập: 8245990
Đang truy cập: 15
Thiết kế web tại Cần Thơ - Miền Tây Net