image Trang chủ image
english vietnam
Dự đoán toàn bộ genome của bắp từ cơ sở dữ liệu lai đơn
Theo: Viện lúa ĐBSCL - Cập nhật lúc: 15:20:15 - 08/12/2012

 

Jon M. Massman và ctv. đã công bố trên tạp chí TAG on-line ngày 10-8-2012 như sau: Các nhà lai tạo giống bắp (Zea mays L.) đánh giá nhiều tổ hợp lai đơn vào mỗi năm tại nhiều điểm khác nhau. Mục đích của họ là xác định tính chất hữu dụng của giá trị phỏng đoán toàn bộ genome (genomewide predictions), trên cơ sở ảnh hưởng của marker từ dữ liệu lai đơn này, xác định tổ hợp lai tối ưu chưa lai thử nghiệm, và dòng cận giao tốt nhất trong cặp lai bố mẹ. Họ xem xét 479 tổ hợp lai đơn giữa 59 dòng cận giao “Iowa Stiff Stalk Synthetic (BSSS) và 44 dòng không cận giao (non-BSSS inbreds). Các tổ hợp lai đơn này được đánh giá trong những thí nghiệm được thực hiện tại nhiều địa điểm khác nhau, trong năm 2001 – 2009. Các dòng cận giao BSSS và non-BSSS cung cấp cơ sở dữ liệu thông qua 669 chỉ thị SNP (single nucleotide polymorphism).


Hiệu quả lai đơn được dự báo bằng phần mềm toán học BLUP (best linear unbiased prediction) sử dụng tính chất “marker-based relatedness” và thông tin có liên quan, từ ảnh hưởng “genomewide marker”, người ta tính toán phương trình “ridge-regression BLUP” (viết tắt là RR-BLUP). Với BLUP, sự chính xác của dự đoán trung bình [mean prediction accuracy] được biểu thị bằng giá trị r MG của hiệu quả lai đơn là 0,87 đối với năng suất, 0,90 đối với ẩm độ hạt, 0,69 đối với đổ ngã của thân, và 0,84 đối với tính bám rễ. Chính mô phỏng BLUP và RR-BLUP đã không dẫn đến giá trị r MG khác biệt một cách có ý nghĩa. Người ta phải sử dụng mô phỏng RR-BLUP model, được phát triển trên cơ sở dữ liệu lai đơn, để dự báo được hiệu quả của lai thử nghiệm (testcrosses) trong 14 quần thể cây bố mẹ (biparental populations).


Các giá trị r MG trong mỗi quần thể testcross thường khá thấp và giá trị âm. Những kết quả như vậy được thu thập cho dù mức độ trung bình của “linkage disequilibrium”, i.e., r 2 giữa các markers liền kề là 0,35 trong các dòng cận giao BSSS và  0,26 trong các dòng non-BSSS. Nhìn chung, những kết quả này cho thấy rằng ảnh hưởng của marker trên toàn bộ genome được ước tính từ các tổ hợp lai đơn không tỏ ra thuận lợi (so với BLUP) để dự báo hiệu quả của tổ hợp lai đơn nào đó và thường cho ra sai số không có ích gì cho việc dự báo hiệu quả của lai thử nghiệm (testcross) giữa bố mẹ. Xem chi tiết 

bình luận 0 Lượt xem 3056
Tin mới hơn
Tin cũ hơn
Bản đồ di truyền của 2 QTL có trong giống cà chua hoang dại Solanum pimpinellifolium L. kiểm soát tính kháng với nhện hai chấm (Tetranychus urticae Koch) (08/12/2012)
Bản đồ QTL qui định tính kháng bệnh “gray leaf spot” (GLS) trên cây bắp (08/12/2012)
Thông báo: Hội thảo quốc tế lần thứ nhất về bệnh Crown Rot trên lúa mì (08/12/2012)
Mối liên quan giữa dinh dưỡng, gen, và sự phát triển bệnh ung thư (08/12/2012)
Hợp nhất vector trong giống khoai tây biến đổi gen “3 R” kháng bệnh héo rũ (Late Blight) (08/12/2012)
Nghiên cứu ảnh hưởng của giống khoai tây tạo ra Cyanophycin đối với đất trồng (08/12/2012)
Thông báo: Đối thoại về Khoa học và Chính sách cho tương lai sản xuất lúa mì ở Châu Phi (08/12/2012)
Catalogue của Genome người (08/12/2012)
Năm genomes của ký sinh gây bệnh sốt rét được giải mã (08/12/2012)
Hiệu quả trên đồng ruộng giống bông Bt được sản xuất theo kiểu bông lai F1 (Hybrids) với các tính trạng Bt: đơn và kết hợp (08/12/2012)
TIN TỨC NỔI BẬT
Xem tất cảicon
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 20/4/2024 đến ngày 6/5/2024 - 09/05/2024
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 19/12/2022 đến ngày 17/1/2023 - 18/01/2023
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 15/11/2022 đến ngày 18/12/2022 - 26/12/2022
Thông báo bảo vệ luận án Tiến sĩ Nông nghiệp cấp Viện (NCS Nguyễn Trọng Phước) - 26/12/2022
Biến dị DROT1 và tính thích nghi khô hạn ở lúa - 27/10/2022
Kiểm soát đạo ôn ở các giống lúa chất lượng cao - 19/09/2022
CÁC MÔ HÌNH TRÌNH DIỄN Ở VIỆN LÚA ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG TRONG SỰ KIỆN AGRITECHNICA LIVE 2022 “CƠ GIỚI HÓA ĐỒNG BỘ HƯỚNG TỚI NỀN NÔNG NGHIỆP BỀN VỮNG” - 19/09/2022
Thông báo tuyến dụng viên chức làm việc tại Cơ quan Viện Khoa học NN Việt Nam và một số đơn vi trực thuộc năm 2022 - 10/08/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 18/7/2022 đến ngày 25/7/2022 - 28/07/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 10/7/2022 đến ngày 14/7/2022 - 28/07/2022
Protocatechuic acid (PCA) từ cám gạo tím ức chế ung thư gan ở chuột - 28/07/2022
Đột biến di truyền có thể kiểm soát sự rụng hạt lúa - 18/07/2022
Tinh bột kháng từ cơm xử lý lạnh giảm sự gia tăng hàm lượng đường trong máu trong bệnh nhân tiểu đường type 1 - 18/07/2022
Khóa huấn luyện điều khiển máy bay không người lái HLD-18 - 18/07/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 26/6/2022 đến ngày 9/7/2022 - 12/07/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 15/6/2022 đến ngày 19/6/2022 - 28/06/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 20/6/2022 đến ngày 25/6/2022 - 28/06/2022
CHỦ TỊCH QUỐC HỘI NƯỚC CỘNG HÒA MÔ-DĂM-BÍCH ĐẾN THĂM VÀ LÀM VIỆC TẠI VIỆN LÚA ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG - 28/06/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 7/6/2022 đến ngày 14/6/2022 - 15/06/2022
Mật độ côn trùng và thiên địch ở Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long từ ngày 29/5/2022 đến ngày 6/6/2022 - 10/06/2022
Video

 

 

 

Thành tích của viện
 Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới năm 2000
 Huân chương độc lập
        - Hạng I năm 2014
       -  Hạng II năm 2007
        - Hạng III năm 2002
 Huân chương lao động
        - Hạng I năm 1996
        - Hạng II năm 1990
        - Hạng III năm 1986
Giải thưởng Hồ Chí Minh về khoa học công nghệ
        - 10 nhà khoa học được nhận năm 2000
Giải thưởng  Kovalepskaia
        - Tập thể các nhà khoa học nữ thuộc Phòng Di truyền giống (năm 1995)
        - Cá nhận TS. Nguyễn Thị Lộc (năm 2011)
Giải Thưởng Bông Lúa Vàng Viết nam lần thứ nhất năm 2012
        - Giống lúa OM 6976 tác giả Trần Thị Cúc Hòa, Phạm Trung Nghĩa và CTV
        - Giống lúa OM 4900 tác giả Nguyễn Thị Lang,  Bùi Chí Bửu và CTV
- Giải thưởng phụ nữ Việt Nam 2013 cho tập thể nữ CBCNVLĐ - Viện lúa ĐBSCL

Liên kết website
Trang chủ | Giới thiêu Viện Lúa ĐBSCL | Sơ đồ site

Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long
Head Office: Tan Thanh Commune, Thoi Lai District, CanTho City
Tel: (+84) 292 3861954; Fax: (+84) 292 3861457
Copyright © 2011 Cuu Long Delta Rice Research Institute

Tổng lượt truy cập: 7678281
Đang truy cập: 1
Thiết kế web tại Cần Thơ - Miền Tây Net