image Trang chủ image
english vietnam

Dữ liệu của 3,000 genome cây lúa đã được công bố và được khai thác miễn phí trên AWS Cloud
Theo: - Cập nhật lúc: 08:18:31 - 04/12/2015

Dự án 3000 genome cây lúa là một dự án quốc tế với sự tham gia của nhiều đối tác trên khắp thế giới. Dự án đã giải trình tự của khoảng 3024 giống lúa có nguồn gốc từ 89 quốc gia trên thế giới. Nguồn dữ liệu khổng lồ này làn guồn tài nguyên vô cùng giá trị cho khai thác các biến dị di truyền tự nhiên của cây lúa cũng như khám phá các gen mới liên quan đến các đặc tính nông học và hiệu quả kinh tế. Dự án này cũng sẽ giúp tăng tốc độ cải tiến các giống lúa trên toàn cầu nhằm hướng đến mục tiêu an ninh lương thực cho một dân số đang tăng trưởng nhanh chóng và sẽ đạt ngưỡng hơn 9.6 tỉ người vào năm 2050 mà trong đó, hơn phân nữa dân số thế giới phụ thuộc vào nguồn lương thực là lúa gạo. 

Ngân hàng gen lúa quốc tế tại IRRI (Philippines) hiện lưu trữ hơn 127.000 giống lúa từ khắp nơi trên thế giới. Những giống lúa này mang nguồn gen/tính trạng quý chưa được khai thác để tạo ra các giống lúa canh tác theo hướng bền vững trong một môi trường ngày càng bất lợi do các thay đổi khí hậu toàn cầu. Các tính trạng được tập trung khai thác cho việc cải tiến giống bao gồm chọn giống lúa giàu dinh dưỡng, chống chịu sâu bệnh hại và môi trường bất lợi như lũ lụt, khô hạn, giảm phát thải khí nhà kính.

Ba viện nghiên cứu gồm viện hàn lâm khoa học nông nghiệp Trung Quốc (CAAS), viện gen Bắc Kinh (BGI) và viện lúa quốc tế IRRI đã hợp tác với nhau để giải trình tự genome của 3024 giống và dòng lúa được lưu trữ tại các ngân hàng gen của IRRI (82%) và tại CAAS (18%). Việc giải trình tự và phân tích dữ liệu được tài trợ bơi quỹ Bill & Melinda Gates kết hợp nguồn tài trợ từ bộ KH&CN Trung Quốc. Cơ sở dữ liệu này chứa hàng triệu trình tự gen từ các giống lúa khác nhau. Khi kết hợp dữ liệu về trình tự gen với các đo đạc về kiểu hình, sự biểu hiện gen và các thông tin khác sẽ cung cấp nền tảng quan trọng để thiết lập các liên kết giữa gen-tính trạng nhằm xây dựng các mô hình dự đoán và ứng dụng các mô hình này cho các chương trình chọn giống trong tương lai.

Thông qua sự tài trợ của chương trình “đối tác khoa học về lúa gạo trên toàn cầu”, 3024 bộ gen của cây lúa đã được lặp lại quá trình giải mã và so sánh đối chiếu với năm giống lúa phổ biến (năm giống này đại diện cho các nhóm phụ đã được trồng phổ biến bao gồm lúa indica, japonica và aus). Dự án 3K RGP đã thu được nguồn dữ liệu khổng lồ lên đến 120 tetrabytes và hiện vượt quá khả năng tính toán của hầu hết các viện nghiên cứu. Tuy vậy, các dữ liệu mới này giờ đây đã được cung cấp miễn phí trên nguồn internet như một nguồn dữ liệu công cộng (Amazon Web Services = AWS). Việc tiếp cận nguồn dữ liệu là hoàn toàn miễn phí và quá trình sử dụng nguồn dữ liệu được kiểm soát bởi các chuyên gia phân tích dữ liệu và người dùng tuân thủ theo tuyên bố Toronto (Toronto Statement). Thông tin chi tiết tại: http://irri.org/news/media-releases/big-data-on-3-000-rice-genomes-available-on-the-aws-cloud

bình luận 0 Lượt xem 2117
Tin mới hơn
Tin cũ hơn
TIN TỨC NỔI BẬT
Xem tất cảicon
THÔNG BÁO MỜI CHÀO HÀNG CẠNH TRANH - 27/12/2018
Các quy tắc đạo đức nghiên cứu trong Viện Lúa ĐBSCL - 11/06/2018
Mô hình truyền thông giảm lượng giống gieo sạ tại các tỉnh vùng ĐBSCL - 26/03/2018
Bản tin hoạt động KHCN Viện Lúa ĐBSCL - Tháng 2/2018 - 12/03/2018
Bản tin hoạt động KHCN – Tháng 1/2018 - 12/03/2018
Thông báo bảo vệ luận án Tiến sĩ Nông nghiệp cấp Viện (NCS Nguyễn Vĩnh Phúc) - 28/11/2017
Bảo hộ giống cây trồng Động lực cho nghiên cứu, chọn tạo giống mới - 29/08/2017
Viện Khoa học Nông Nghiệp Việt Nam Thông báo tuyển sinh trình độ tiến sỹ năm 2017 đợt 2 - 15/08/2017
Bản tin tháng 6 năm 2017 của hiệp hội các Viện nghiên cứu Châu Á-Thái Bình Dương - 15/08/2017
About CLRRI - 15/08/2017
Bí thư Thành ủy Cần Thơ Trần Quốc Trung cùng đoàn công tác làm việc với Viện Lúa BSCL - 11/08/2017
Thông báo đề xuất dự án hợp tác KH&CN với Cộng hòa liên bang Đức - 09/08/2017
Thông tin về quỹ tài trợ Newton, International Climate Fund và GCRF - 20/06/2017
Thông báo về việc viết bài cho tạp chí Omonrice 21 - 25/04/2017
Thông báo mời thầu gói thầu FIRST/CLRRI/G04 - 28/03/2017
Thông báo mời thầu gói thầu FIRST/CLRRI/G1 và gói FIRST/CLRRI/G02 - 16/03/2017
HỘI THẢO GIỚI THIỆU VÀ KHUYẾN KHÍCH SỬ DỤNG CÁC GIỐNG LÚA MỚI CỦA VIỆN LÚA ĐBSCL TẠI HẬU GIANG ĐÔNG XUÂN 2016-2017 - 09/03/2017
HỘI THẢO GIỚI THIỆU VÀ KHUYẾN KHÍCH SỬ DỤNG CÁC GIỐNG LÚA MỚI CỦA VIỆN LÚA ĐBSCL TẠI HẬU GIANG ĐÔNG XUÂN 2016-2017 - 09/03/2017
Đề xuất dự án thuộc chương trình Nông thôn miền núi thực hiện từ năm 2018 - 03/03/2017
Thông báo nhiệm vụ công nghệ tiên tiến - 17/02/2017
Video

 

 

 

Thành tích của viện
 Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới năm 2000
 Huân chương độc lập
        - Hạng I năm 2014
       -  Hạng II năm 2007
        - Hạng III năm 2002
 Huân chương lao động
        - Hạng I năm 1996
        - Hạng II năm 1990
        - Hạng III năm 1986
Giải thưởng Hồ Chí Minh về khoa học công nghệ
        - 10 nhà khoa học được nhận năm 2000
Giải thưởng  Kovalepskaia
        - Tập thể các nhà khoa học nữ thuộc Phòng Di truyền giống (năm 1995)
        - Cá nhận TS. Nguyễn Thị Lộc (năm 2011)
Giải Thưởng Bông Lúa Vàng Viết nam lần thứ nhất năm 2012
        - Giống lúa OM 6976 tác giả Trần Thị Cúc Hòa, Phạm Trung Nghĩa và CTV
        - Giống lúa OM 4900 tác giả Nguyễn Thị Lang,  Bùi Chí Bửu và CTV
- Giải thưởng phụ nữ Việt Nam 2013 cho tập thể nữ CBCNVLĐ - Viện lúa ĐBSCL

Liên kết website
Trang chủ | Sơ đồ site

Viện Lúa Đồng Bằng Sông Cửu Long
Head Office: Tan Thanh Commune, Thoi Lai District, CanTho City
Tel: (+84) 292 3861954; Fax: (+84) 292 3861457
Copyright © 2011 Cuu Long Delta Rice Research Institute

Tổng lượt truy cập: 7187643
Đang truy cập: 1
Thiết kế web tại Cần Thơ - Miền Tây Net