Phát triển giống lúa có năng suất cao và ổn định, chống chịu sâu bệnh hại chính, thích nghi điều kiện bất lợi do môi trường, đáp ứng yêu cầu phát triển bền vững

Phát triển giống lúa có phẩm chất gạo ngon, đáp ứng xuất khẩu và nội tiêu

Bảo tồn tài nguyên di truyền cây lúa và một số cây trồng trong vùng trồng lúa

Nghiên cứu di truyền và chọn tạo giống lúa, giống cây trồng theo hướng phát triển bền vững, đáp ứng mục tiêu phát triển của quốc gia trong từng thời kỳ

Đào tạo cán bộ khoa học ngắn hạn và dài hạn (trình độ Tiến sĩ) chuyên ngành di truyền - giống

Tăng cường hợp tác quốc tế, hợp tác với địa phương trong nghiên cứu và phát triển giống lúa, giống cây trồng

Thu thập, bảo quản, đánh giá, tư liệu hóa và sử dụng hợp lý qũy gen cây lúa và một số cây trồng khác trong vùng trồng lúa, để thực hiện mục tiêu đa dạng sinh học, sử dụng vật liệu bố mẹ có định hướng đáp ứng yêu cầu cải tiến giống cây trồng

Nghiên cứu genome học và genome học chức năng cây trồng mục tiêu; phát triển  những lĩnh vực mới như proteomics, transcriptomics; ứng dụng tin sinh học, đáp ứng nhu cầu nghiên cứu cơ bản về di truyền phân tử, công nghệ di truyền, kết hợp với các phương pháp truyền thống làm cơ sở chọn tạo giống.

Nghiên cứu khai thác vật liệu di truyền từ nguồn hoang dại và loài bản địa, làm đa dạng nguồn gen, kết hợp với đột biến gen, biến dị somatic hoặc gametic, xây dựng chiến lược chọn lọc trên cơ sở di truyền số lượng, nhằm tạo chọn giống năng suất cao, ổn định, chống chịu stress sinh học và phi sinh học, gia tăng hàm lượng dinh dưỡng nông sản

Thực hiện các phương pháp chuyển gen, du nhập gen mục tiêu từ ngân hàng gen vào giống cây trồng, kết hợp với hồi giao cải tiến, ứng dụng dấu chuẩn phân tử trong chọn giống (MAS), đánh giá hiệu qủa chọn lọc tính trạng mục tiêu, phân tích QTL, phân tích chuỗi trình tự gen mục tiêu, thiết kế những cặp mồi liên kết chặt chẽ với gen mục tiêu, hoàn thiện không ngừng qui trình chọn giống truyền thống và phân tử.

Ứng dụng công nghệ sinh học trong chọn giống :  Chức năng genome , Công nghệ gen, Kỹ thuật di truyền , Kiểm tra về GMO các cây có liên quan

Tạo điều kiện thuận lợi cho nghiên cứu sinh, thực tập sinh sau Tiến sĩ (post-doct), sinh viên đến thực tập về di truyền-giống; đào tạo tiến sĩ chuyên ngành di truyền - giống

Thực hiện các hoạt động so sánh năng suất, phân tích tương tác GxE, trồng thử, chuyển giao giống mới ở các địa phương trong vùng mục tiêu

Thực hiện các đề tài, dự án hợp tác quốc tế về các lĩnh vực có liên quan